在荧光显微镜使用初期，显微镜学家观察的是初级荧光或自体荧光，但现在已开发出许多染料，能够发出更加明亮的荧光，可用来给样品的某些部分染色，这种方法称为次级或间接荧光。

荧光显微镜是荧光显微检测的专用工具,它是光学显微镜的一种。它除了具有光学显微镜的基本结构和光学放大作用外,基于荧光的特性,还具备以下独特的功能要求:

(1)提供足够能量的能激发出荧光的光源。

(2)有着适应不同物质所需的激发光谱一组滤色片,从光源中选择合适的激发光谱,使析出的光谱与该物质的吸收光谱重合,以期望获得荧光。

(3)为获得较弱的荧光图像,还要建立一套截止滤色片,它使所需观察的荧光进入系统成像,而将其余的光波,包括发射光阻挡在外,用来提高图像的衬度。

(4)放大的光学系统应适应荧光的特性,获得既能观察又能摄影的高亮度、高分辨力的良好衬度的荧光图像。

明美倒置荧光显微镜MF52-N可应用于细胞组织，透明液态组织的显微观察，也可用于生物制药，医学检测、疾病预防等领域内的荧光显微观察。